乱斗西游的主线任务以天命者为核心展开，玩家扮演的角色被神佛选为第二代取经人，肩负平定三界之乱的重任。故事从长安城的神秘梦境开始，劫灾场景的浮现暗示着上古浩劫与三界离乱的关联。主线任务通过层层推进的剧情设计，逐步揭露五百年前真假美猴王事件的真相——真正的孙悟空在地府之战中被打杀，而陪伴唐僧完成取经的实则是六耳猕猴。这一颠覆性设定成为贯穿主线的重要伏笔，也是玩家探索三界动荡根源的关键线索。
主线任务中，李靖作为重要NPC多次出现，其任务线不仅推动剧情发展，更与七大BOSS讨伐战紧密相连。长安城任务要求玩家等级达到20级方可接取，而40级以上的玩家可组队挑战尸王、剑士、妖道等七大BOSS。这些任务并非孤立存在，每个BOSS背后都暗藏与主线相关的支线信息，例如妖道的出现与六耳猕猴势力存在潜在联系。任务奖励暗香篮可兑换的蛟魔王等道具，也侧面补充了主线中妖族阵营的设定。
游戏通过主城任务与副本的嵌套设计，构建出多维度的叙事结构。玩家在完成破阵夺宝神秘商队等任务时，会逐步发现取经之路背后的权力博弈。神佛表面宣称普度众生，实则对妖魔采取镇压手段，这种矛盾在主线后期集中爆发。地府窜出的魔悟空直指天庭，进一步质疑了第一次取经的真实目的，而玩家作为天命者需要在这种混沌中做出选择。
主线任务最精妙之处在于将传统西游元素进行重构。白骨精、红孩儿等经典角色不再单纯作为敌人出现，其任务线往往包含对自身命运的挣扎。例如白骨化心途关卡中，白骨精的自爆小怪机制暗喻其被操控的悲剧性；而火焰山关卡禁止使用芭蕉扇的设计，则暗示红孩儿与铁扇公主反抗天庭的合理性。这些细节使主线故事超越简单的正邪对立。
乱斗西游通过主城建筑、NPC对话等环境叙事手段强化主线沉浸感。长安城的市井对话中隐藏着对天命者的议论，李靖府邸的装饰暗含对封神旧事的影射。当玩家推进到后期章节时，会发现早期任务中埋设的线索——如南海龙王的只言片语或阎罗殿的判官笔，都在为最终揭露六耳猕猴取代悟空的惊天阴谋服务。这种草蛇灰线的叙事手法，使主线任务具备值得反复推敲的叙事深度。